柴油发电机组在运行的时候，机油必须在发动机内不断地被过滤和清洁，而这一项将由机油滤清器来完成，机油滤清器可去除机油中的灰尘、金属颗粒、碳沉淀物和煤烟颗粒等杂质，以保护发动机，目前柴油发电机组有两种机油过滤系统：全流式系统和旁通式系统。
柴油发电机组
旁通式滤清器
采用旁通式滤清器的柴油发电机组在运行时大约90%的机油被直接泵到发动机，仅约10%的机油被送到机油滤清器来过滤。如果该滤清器堵塞，则会卖到所有机油均无法被过滤，机油将会在没有任何过滤的情况下被加压送入发动机。
全流式滤清器
在全流式系统中，所有机油在进入发动机前都必须穿过机油滤清器。如果杂质堵塞了机油滤清器，滤清器前的机油压力将升高，从而导致卸压阀打开。在滤清器前后的压力差约为5~40psi时，卸压阀打开，这称为差压，差压是滤清器的进口和出口之间的压力差。进口压力始终由压力调节阀控制着，当机油滤清器使用一段时间后堵塞时，滤清器的另一侧的压力将降低，当压差等于卸压阀的设置时，一定量的机油将穿过滤清器，进入发动机。这意味着即使滤清器阻塞了，发动机仍能得到机油。如果滤清器被完全堵塞了，那么机油压力会稍微低于正常的压力。
在技术发展比较落后的以前，柴油发电机组只使用旁通式系统，随着技术的提高，以及过滤发动机机油的需求量加大，现在的机组使用的均是全流式系统。机油滤清器要定期更换，如果是新机组，在首次工作50小时后便要更换一次机油滤清器，之后一般是200小时更换一次，但是由于机组使用环境及使用时间的不同，更换周期也会有所不同，具体可咨询专业发电机厂家。